RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TAAR5O14804 337 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ARPC5O15511 151 aa11.3□□□□□ -0.6
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PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R45P59539 299 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 RHOBP62745 196 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF182Q8N6D2 247 aa11.28□□□□□ -0.6
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.27□□□□□ -0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.27□□□□□ -0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.26□□□□□ -0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.26□□□□□ -0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 OR11H2Q8NH07 326 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 IL17DQ8TAD2 202 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF141Q8WVD5 230 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 PRELID1Q9Y255 219 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC17A3O00476 420 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 BLNKQ8WV28 456 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 XCL2Q9UBD3 114 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 RYR3Q15413 4870 aa11.24□□□□□ -0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-DMBP28068 263 aa11.23□□□□□ -0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 RFNGQ9Y644 331 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10J4P0C629 311 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC7Q8TAX7 377 aa11.22□□□□□ -0.61
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