RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 MGST2Q99735 147 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ARL6Q9H0F7 186 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.6□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.59□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.59□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.59□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 ISLRO14498 428 aa5.59□□□□□ -1.51
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SGMS1-201ENST00000361543 CXCL2P19875 107 aa5.59□□□□□ -1.51
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SGMS1-201ENST00000361543 NHLH2Q02577 135 aa5.59□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.59□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.59□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.59□□□□□ -1.51
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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SGMS1-201ENST00000361543 ARV1Q9H2C2 271 aa5.59□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.59□□□□□ -1.51
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SGMS1-201ENST00000361543 H3BRN7 92 aa5.58□□□□□ -1.52
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SGMS1-201ENST00000361543 MBP02144 154 aa5.58□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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SGMS1-201ENST00000361543 Q5BKY6 102 aa5.58□□□□□ -1.52
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SGMS1-201ENST00000361543 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.58□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.58□□□□□ -1.52
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SGMS1-201ENST00000361543 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A22Q9H936 323 aa5.58□□□□□ -1.52
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SGMS1-201ENST00000361543 HMSDA8MTL9 139 aa5.57□□□□□ -1.52
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SGMS1-201ENST00000361543 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
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SGMS1-201ENST00000361543 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.56□□□□□ -1.52
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SGMS1-201ENST00000361543 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.56□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 HRH4Q9H3N8 390 aa5.56□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 RPRMQ9NS64 109 aa5.56□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.56□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 X6R8D5 127 aa5.56□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 ARPC5O15511 151 aa5.55□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF253O75346 499 aa5.55□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 LY6G6CO95867 125 aa5.55□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SGMS1-201ENST00000361543 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.55□□□□□ -1.52
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