RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 VAMP1P23763 118 aa13.06□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 TNP2Q05952 138 aa13.06□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 PRM2P04554 102 aa13.05□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 TMEM144Q7Z5S9 345 aa13.05□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.05□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 C6orf223Q8N319 242 aa13.05□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 CBY3A6NI87 242 aa13.04□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 C16orf90A8MZG2 172 aa13.04□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 DEFB130BP0DP73 79 aa13.04□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 DEFB130AP0DP74 79 aa13.04□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 CCL18P55774 89 aa13.04□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 AKAP14Q86UN6 197 aa13.04□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 MITD1Q8WV92 249 aa13.04□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 F5H768 121 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 H3BRN7 92 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 WRBO00258 174 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 ATP5G1P05496 136 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 AZU1P20160 251 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 ATP5G3P48201 142 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 TAS2R60P59551 318 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 PLP1P60201 277 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 FCN2Q15485 313 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 SPANXN5Q5MJ07 72 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 BAP18Q8IXM2 172 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PUS1-201ENST00000322060 CCNKO75909 580 aa13.02□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 AKR1C1Q04828 323 aa13.02□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 RNF182Q8N6D2 247 aa13.02□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 ZNF738Q8NE65 137 aa13.02□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 A0A087X0K7 114 aa13.01□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 NUDT3O95989 172 aa13.01□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 RAP2BP61225 183 aa13.01□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa13.01□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 OR8A1Q8NGG7 326 aa13.01□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 LINC01587Q99440 93 aa13.01□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 MGAT4CQ9UBM8 478 aa13.01□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 HYPMO75409 117 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 CXCL3P19876 107 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 SELENOTP62341 195 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 ID3Q02535 119 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 FGL1Q08830 312 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 ZNF493Q6ZR52 646 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 S100A7AQ86SG5 101 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 C16orf74Q96GX8 76 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 RNF24Q9Y225 148 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 HIGD1AQ9Y241 93 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 LINC00588Q9Y4M8 146 aa13□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 ABCA13Q86UQ4 5058 aa12.99□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 PSG3Q16557 428 aa12.99□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 GOSR2O14653 212 aa12.98□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 HOXB5P09067 269 aa12.98□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 RHOBP62745 196 aa12.98□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 RNF141Q8WVD5 230 aa12.98□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa12.98□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 PMS2P5A8MQ11 134 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 H3BP45 60 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 K7EPK0 472 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 LINC00869P0C866 280 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 CDKN1BP46527 198 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 ASB13Q8WXK3 278 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 ZNF503Q96F45 646 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 ST6GAL2Q96JF0 529 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 HSPG2P98160 4391 aa12.97□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 FNDC10F2Z333 226 aa12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 CXCL2P19875 107 aa12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 CLINT1Q14677 625 aa12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 SSX7Q7RTT5 188 aa12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 TCTE3Q8IZS6 198 aa12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 OR10J6PQ8NGY7 276 aa12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 Q9H8V8 135 aa12.96□□□□□ -0.33
PUS1-201ENST00000322060 H7BYZ3 331 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 GIPP09681 153 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 OR5G3P0C626 314 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 DLK1P80370 383 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 LINC00612Q8N6U2 182 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 LRRC20Q8TCA0 184 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 SMIM8Q96KF7 97 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 UHRF2Q96PU4 802 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 NPVFQ9HCQ7 196 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 PSENENQ9NZ42 101 aa12.95□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 SMCO3A2RU48 225 aa12.94□□□□□ -0.34
PUS1-201ENST00000322060 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms