RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 HAGHQ16775 308 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SSX7Q7RTT5 188 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 RPRMQ9NS64 109 aa6.71□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ISLRO14498 428 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 S100A7P31151 101 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 PSMB3P49720 205 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 S100A7AQ86SG5 101 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 HRH4Q9H3N8 390 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFB4O95168 129 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF726P1Q15940 193 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 BLNKQ8WV28 456 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 FXYD5Q96DB9 178 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 HYLS1Q96M11 299 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 RETNQ9HD89 108 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 OR7C2O60412 319 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 PFDN1O60925 122 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV3-20P01619 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SPP1P10451 314 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ID1P41134 155 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 MEOX2P50222 304 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 RHOBP62745 196 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SERF2P84101 59 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP69Q49AA0 526 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 OR51M1Q9H341 326 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 H3BMM0 161 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 FHITP49789 147 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 LCN15Q6UWW0 184 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 RNF141Q8WVD5 230 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 RAB24Q969Q5 203 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 PAXXQ9BUH6 204 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PPV4 95 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 PRAC2D3DTV9 90 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 M0R3E3 92 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 STHQ8IWL8 128 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 RNF24Q9Y225 148 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 HLA-DRB4P13762 266 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 PSG3Q16557 428 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 BAP18Q8IXM2 172 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF738Q8NE65 137 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 TMED6Q8WW62 240 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0J9YX75 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 STAG3L2P0CL84 134 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 STAG3L3P0CL85 134 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 C4BPBP20851 252 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 FXYD7P58549 80 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 KHDC3LQ587J8 217 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 MBP02144 154 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SEC11BP0C7V7 166 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 RANP62826 216 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 ICAM4Q14773 271 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 GUK1Q16774 197 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 DEFB135Q30KP9 77 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 STOML3Q8TAV4 291 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms