RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa18.18■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF738Q8NE65 137 aa18.18■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 ASB13Q8WXK3 278 aa18.18■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 KCNIP2Q9NS61 270 aa18.18■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 GIPP09681 153 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 HLA-DMBP28068 263 aa18.17■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 FXYD7P58549 80 aa18.17■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 GCSAMLQ5JQS6 135 aa18.17■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 LCN15Q6UWW0 184 aa18.17■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 CSMD3Q7Z407 3707 aa18.17■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 C17orf112F2Z3M2 114 aa18.16■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 H3BTX0 84 aa18.16■□□□□ 0.5
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CXCL2-201ENST00000296031 HRH4Q9H3N8 390 aa18.16■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 H3BQ15 152 aa18.15■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 PSG9Q00887 426 aa18.15■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 PSG3Q16557 428 aa18.15■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 SCGB1C1Q8TD33 95 aa18.15■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 SLC50A1Q9BRV3 221 aa18.15■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 SLC35B3Q9H1N7 401 aa18.15■□□□□ 0.5
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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CXCL2-201ENST00000296031 WFDC1Q9HC57 220 aa18.14■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 STARD9Q9P2P6 4700 aa18.14■□□□□ 0.49
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CXCL2-201ENST00000296031 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
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CXCL2-201ENST00000296031 SLC17A3O00476 420 aa18.12■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 CNN1P51911 297 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 PMS2P11Q13670 270 aa18.12■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 MFFQ9GZY8 342 aa18.12■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM14CQ9P0S9 112 aa18.12■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 X6R8D5 127 aa18.12■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 MIFP14174 115 aa18.11■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 Q8NAQ8 132 aa18.11■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 AQP10Q96PS8 301 aa18.11■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF586Q9NXT0 402 aa18.11■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa18.1■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 CXorf65A6NEN9 183 aa18.1■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 AMTNQ6UX39 209 aa18.1■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 FFAR4Q5NUL3 377 aa18.09■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 MIR17HGQ75NE6 70 aa18.09■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 OR8A1Q8NGG7 326 aa18.09■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 OR2T35Q8NGX2 323 aa18.09■□□□□ 0.49
CXCL2-201ENST00000296031 PYYP10082 97 aa18.08■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 SLC25A2Q9BXI2 301 aa18.08■□□□□ 0.48
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CXCL2-201ENST00000296031 FUT9Q9Y231 359 aa18.08■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 TRBV19A0A075B6N1 114 aa18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF253O75346 499 aa18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 RBMY1CP0DJD4 496 aa18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa18.07■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 RHOBP62745 196 aa18.06■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 RFNGQ9Y644 331 aa18.06■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa18.05■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 M0R2Z0 102 aa18.05■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF266Q14584 549 aa18.05■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 SPINK13Q1W4C9 94 aa18.05■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 C11orf45Q8TAV5 145 aa18.05■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 BLNKQ8WV28 456 aa18.05■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa18.05■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.05■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 AMBPP02760 352 aa18.04■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 PDE6HQ13956 83 aa18.04■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 OR51M1Q9H341 326 aa18.04■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa18.04■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 PRAC2D3DTV9 90 aa18.03■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa18.03■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 NDUFB4O95168 129 aa18.03■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa18.03■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 NEU1Q99519 415 aa18.03■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 TNFSF18Q9UNG2 199 aa18.03■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 RNF222A6NCQ9 220 aa18.02■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 G3V3Q6 166 aa18.02■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 C1orf158Q8N1D5 194 aa18.02■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 OR10J6PQ8NGY7 276 aa18.02■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 PAXXQ9BUH6 204 aa18.02■□□□□ 0.48
CXCL2-201ENST00000296031 NUPR2A6NF83 97 aa18.01■□□□□ 0.47
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM9A6NGZ8 99 aa18.01■□□□□ 0.47
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