RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 ADAP1O75689 374 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 AMTNQ6UX39 209 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 M0R2N4 97 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 SIX6O95475 246 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 HTN3P15516 51 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 SELENOTP62341 195 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 S100A7AQ86SG5 101 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 SMIM8Q96KF7 97 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.97□□□□□ -0.01
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NEDD8-201ENST00000250495 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-201ENST00000250495 HERC2O95714 4834 aa14.96□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.95□□□□□ -0.02
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NEDD8-201ENST00000250495 RNF212Q495C1 297 aa14.95□□□□□ -0.02
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NEDD8-201ENST00000250495 L7N2F9 121 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 SSSCA1O60232 199 aa14.94□□□□□ -0.02
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NEDD8-201ENST00000250495 LINC00869P0C866 280 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 RNF182Q8N6D2 247 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 NMES1Q9C002 83 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 RNF24Q9Y225 148 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1B0GVY2 172 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF738Q8NE65 137 aa14.93□□□□□ -0.02
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NEDD8-201ENST00000250495 FNDC10F2Z333 226 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 M0R2Z0 102 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 RTL8CO15255 209 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.91□□□□□ -0.02
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF345Q14585 488 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 TEPPQ6URK8 271 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 TEX261Q6UWH6 196 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 ARL6Q9H0F7 186 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 A0A087X0K7 114 aa14.9□□□□□ -0.02
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NEDD8-201ENST00000250495 S100A11P31949 105 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 TAS2R30P59541 319 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 RHOBP62745 196 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 OPCMLQ14982 345 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 PSG3Q16557 428 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 FAM210AQ96ND0 272 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 UHRF2Q96PU4 802 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0D9SG52 128 aa14.89□□□□□ -0.03
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NEDD8-201ENST00000250495 ARPC5O15511 151 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 TSC22D2O75157 780 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 SCGB1D2O95969 90 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 IFNA7P01567 189 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 PRM2P04554 102 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 Q6ZR54 194 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 ARV1Q9H2C2 271 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 DNAH2Q9P225 4427 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 C5orf51A6NDU8 294 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 PATE2Q6UY27 113 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 TMUB2Q71RG4 321 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 BAP18Q8IXM2 172 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 THAP6Q8TBB0 222 aa14.88□□□□□ -0.03
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