RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 COTL1Q14019 142 aa21.39■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 COX8AP10176 69 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 IGF2-ASQ6U949 168 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 APC2O95996 2303 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 CD5LO43866 347 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 RIGQ13278 110 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 NGBQ9NPG2 151 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 S4R3C0 116 aa21.38■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 LYNX1G3V0Z9 82 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 LYNX1P0DP58 116 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 PLGLAQ15195 96 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 E7EQL1 145 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 RBPJQ06330 500 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 LRBAP50851 2863 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 TTC28Q96AY4 2481 aa21.37■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PRD5 423 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PRF3 423 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PRM7 423 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 VSTM5A8MXK1 200 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 PAX2Q02962 417 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 C8orf49Q96NF6 230 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 PSG8Q9UQ74 426 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 TRBV19A0A075B6N1 114 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 C7orf71A4D174 169 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 OR10AG1Q8NH19 301 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 BSNQ9UPA5 3926 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 ACACAQ13085 2346 aa21.36■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 A0A096LNJ9 63 aa21.35■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 CSN1S1P47710 185 aa21.35■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 PIP4P2Q8N4L2 257 aa21.35■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 TNFRSF14Q92956 283 aa21.35■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 DCHS2Q6V1P9 2916 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 GAGE12BA1L429 117 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM213A2RRL7 107 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 RPEQ96AT9 228 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 SCNM1Q9BWG6 230 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 SHISA9B4DS77 424 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 D6R8Y8 96 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 CNIH1O95406 144 aa21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 IGFBPL1Q8WX77 278 aa21.33■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa21.33■■□□□ 1.01
FAM149A-201ENST00000227065 PPBPP02775 128 aa21.32■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 PSG3Q16557 428 aa21.32■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 AMN1Q8IY45 258 aa21.32■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM75Q8N9X5 138 aa21.32■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 K7EIM0 57 aa21.31■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM97Q5BJF2 176 aa21.31■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa21.31■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa21.3■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 NHLH1Q02575 133 aa21.3■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 IL4P05112 153 aa21.3■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 LYZL1Q6UWQ5 148 aa21.3■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 RABAC1Q9UI14 185 aa21.3■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa21.3■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 H3BRN7 92 aa21.29■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 FGF6P10767 208 aa21.29■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF491Q8N8L2 437 aa21.29■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 JKAMPQ9P055 326 aa21.29■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 HILPDAQ9Y5L2 63 aa21.29■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 K7EQM0 130 aa21.28■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 CACNG7P62955 275 aa21.28■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa21.28■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 PPIAL4GP0DN37 164 aa21.28■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 GFRALQ6UXV0 394 aa21.28■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 RPS20P60866 119 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 RNF125Q96EQ8 232 aa21.27■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF414Q96IQ9 312 aa21.27■■□□□ 1
FAM149A-201ENST00000227065 SMKR1H3BMG3 65 aa21.27■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 WFDC3Q8IUB2 231 aa21.27■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 PRELID3AQ96N28 172 aa21.27■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 S100A7P31151 101 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 TIMM23O14925 209 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 SAP30O75446 220 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 CT45A10P0DMU9 189 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 GATD1Q8NB37 220 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 ABHD17AQ96GS6 310 aa21.26■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 JMJD8Q96S16 334 aa21.25■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 THYN1Q9P016 225 aa21.25■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 SPTBN2O15020 2390 aa21.24■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 GAGE10A6NGK3 116 aa21.24■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 PRSS57Q6UWY2 283 aa21.23■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 LYPD1Q8N2G4 141 aa21.23■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 SEC11AP67812 179 aa21.23■□□□□ 0.99
FAM149A-201ENST00000227065 ONECUT1Q9UBC0 465 aa21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.1 ms