RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636607.1

ARID1B-217, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 3

Gene ARID1B, Length 406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-217	ENST00000636607	SLC25A22	Q9H936	323 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607		A0A096LPF7	62 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ZNF98	A6NK75	572 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ZFP92	A6NM28	416 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	PSCA	O43653	123 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	OXT	P01178	125 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	IGKV1-5	P01602	117 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	APOA1	P02647	267 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	PI3	P19957	117 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RCVRN	P35243	200 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	GALR1	P47211	349 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	INPP1	P49441	399 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RND3	P61587	244 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	IL18	Q14116	193 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	GAMT	Q14353	236 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TP53RK	Q96S44	253 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RSG1	Q9BU20	258 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607		H3BNG1	76 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	NXPH3	O95157	252 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	MEOX2	P50222	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	PIGP	P57054	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SPCS3	P61009	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ZNF90	Q03938	601 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	OR2F1	Q13607	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SP6	Q3SY56	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	CTDSP2	O14595	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	FABP1	P07148	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607		H7BYZ3	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	EVI2A	P22794	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARID1B-217	ENST00000636607	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-217	ENST00000636607		A8MTW9	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-217	ENST00000636607		J3KRW8	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-217	ENST00000636607	PAX4	O43316	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-217	ENST00000636607	CDS2	O95674	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARID1B-217	ENST00000636607	CD3D	P04234	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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