RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591315.5

VMP1-211, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene VMP1, Length 800 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-211ENST00000591315 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 APOC4P55056 127 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 PRR20EP86478 221 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 PRR20CP86479 221 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 PRR20DP86480 221 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 PRR20BP86481 221 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 PRR20AP86496 221 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 BAXQ07812 192 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 Q5BKY6 102 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 ZNF546Q86UE3 836 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 CSTL1Q9H114 145 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 ARV1Q9H2C2 271 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 FBXL17Q9UF56 701 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.44□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 H3BTX0 84 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 SPRY2O43597 315 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 HLA-DMBP28068 263 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 GALR1P47211 349 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 RAP2BP61225 183 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 HBG1P69891 147 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 HBG2P69892 147 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 FGL1Q08830 312 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 OPCMLQ14982 345 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 RGS21Q2M5E4 152 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 Q6ZWC4 215 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 STHQ8IWL8 128 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 RNF183Q96D59 192 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 MED28Q9H204 178 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 WFDC1Q9HC57 220 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 RFNGQ9Y644 331 aa8.43□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 H3BMM0 161 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 UBE2CO00762 179 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 COX7A2P2O60397 106 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 IGKV3-20P01619 116 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 OXA1LQ15070 435 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 ATP6V1FQ16864 119 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 RNF182Q8N6D2 247 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 MUC7Q8TAX7 377 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.42□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.42□□□□□ -1.06
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VMP1-211ENST00000591315 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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VMP1-211ENST00000591315 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 C16orf92Q96LL3 132 aa8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 HSPB11Q9Y547 144 aa8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 A0A0J9YWU9 116 aa8.4□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 ISLRO14498 428 aa8.4□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 LYL1P12980 280 aa8.4□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 ID1P41134 155 aa8.4□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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VMP1-211ENST00000591315 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.4□□□□□ -1.06
VMP1-211ENST00000591315 H3BQ15 152 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 SLC17A3O00476 420 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 DEFB4AO15263 64 aa8.39□□□□□ -1.07
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VMP1-211ENST00000591315 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 Q6ZRG5 221 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 OR11H2Q8NH07 326 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 GPR82Q96P67 336 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 XCL2Q9UBD3 114 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.39□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.38□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 A0A087X0K7 114 aa8.38□□□□□ -1.07
VMP1-211ENST00000591315 G3V3Q6 166 aa8.38□□□□□ -1.07
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