RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PS18 150 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A9P06702 114 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
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CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5G3P48201 142 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE6HQ13956 83 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF674Q2M3X9 581 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM90A2PQ658T7 463 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 OR8I2Q8N0Y5 310 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BAQ96A08 127 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf52Q96A22 123 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF503Q96F45 646 aa17.53■□□□□ 0.4
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CAPNS1-212ENST00000591041 PYYP10082 97 aa17.52■□□□□ 0.4
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CAPNS1-212ENST00000591041 RNF152Q8N8N0 203 aa17.51■□□□□ 0.39
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CAPNS1-212ENST00000591041 BLNKQ8WV28 456 aa17.51■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 KLK15Q9H2R5 256 aa17.51■□□□□ 0.39
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZFAND3Q9H8U3 227 aa17.51■□□□□ 0.39
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CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
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CAPNS1-212ENST00000591041 DUX5Q96PT3 197 aa17.5■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 C20orf24Q9BUV8 137 aa17.5■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EQM0 130 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFB4O95168 129 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-11P01762 117 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CNN1P51911 297 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf17Q8NAS9 161 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 UFC1Q9Y3C8 167 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP5D1E7EU14 171 aa17.48■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF253O75346 499 aa17.48■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 AKR1C3P42330 323 aa17.48■□□□□ 0.39
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CAPNS1-212ENST00000591041 AWAT1Q58HT5 328 aa17.48■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LEMD1Q68G75 181 aa17.48■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS10P5Q9NQ39 176 aa17.48■□□□□ 0.39
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CAPNS1-212ENST00000591041 HELTA6NFD8 242 aa17.47■□□□□ 0.39
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CAPNS1-212ENST00000591041 C16orf95Q9H693 158 aa17.47■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SDF2L1Q9HCN8 221 aa17.47■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SMCO4Q9NRQ5 59 aa17.47■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LY96Q9Y6Y9 160 aa17.47■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 FN1P02751 2386 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV19A0A075B6N1 114 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WWC5 75 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SCO2A0A1W2PP80 73 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PGPA6NDG6 321 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 C9JCJ5 164 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EMT4 169 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 MT-ND4LP03901 98 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TAS2R60P59551 318 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZSV7 163 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 MYOZ3Q8TDC0 251 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 Q9H3A6 140 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SERTAD4Q9NUC0 356 aa17.46■□□□□ 0.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TLN2Q9Y4G6 2542 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa17.45■□□□□ 0.38
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CAPNS1-212ENST00000591041 GGTLC3B5MD39 225 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLC2P0DOY2 106 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMD13Q5VXD3 122 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CTDSP1Q9GZU7 261 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 COL6A5A8TX70 2615 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF320A2RRD8 509 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 C7orf77A4D0Y5 90 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PEX7O00628 323 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R2P9O14990 202 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 BUB3O43684 328 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 GNG4P50150 75 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2G1P62253 170 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ADIRFQ15847 76 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ATG101Q9BSB4 218 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 BIN3Q9NQY0 253 aa17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CAPNS1-212ENST00000591041 EPDR1Q9UM22 224 aa17.44■□□□□ 0.38
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