RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 TIGITQ495A1 244 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 C9orf85Q96MD7 179 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 PRNDQ9UKY0 176 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 A0A087WYN8 130 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 FAM223BA6NKX1 122 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 LINC01619G3V211 115 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 CDS2O95674 445 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 DHFRP00374 187 aa5.66□□□□□ -1.5
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ATG4D-210ENST00000588972 OR13C7P0DN81 318 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF616Q08AN1 781 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 PPP1R1AQ13522 171 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 C15orf32Q32M92 178 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 REG3GQ6UW15 175 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35G3Q8N808 338 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 GALNT14Q96FL9 552 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM56Q96MV1 263 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 JPT2Q9H910 190 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 NUDT15Q9NV35 164 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.66□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 SORL1Q92673 2214 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0G2JLM5 398 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 PPP5D1E7EU14 171 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 ATG12O94817 140 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 BRI3O95415 125 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 IL5P05113 134 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 OR8U8P0C7N1 319 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 DEFA4P12838 97 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 PRCDQ00LT1 54 aa5.65□□□□□ -1.5
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ATG4D-210ENST00000588972 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 NECAP1Q8NC96 275 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 OR5B3Q8NH48 314 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 DCUN1D4Q92564 292 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 GPR146Q96CH1 333 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 USMG5Q96IX5 58 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.65□□□□□ -1.5
ATG4D-210ENST00000588972 HERC2O95714 4834 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 C7orf66A4D0T2 115 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 EPM2AB3EWF7 344 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 OVOL1O14753 267 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 SFT2D2O95562 160 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 IFNA17P01571 189 aa5.64□□□□□ -1.51
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ATG4D-210ENST00000588972 IL22RA2Q969J5 263 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0B4J2A0 478 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 C9orf170A2RU37 121 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 OR4E1P0C645 316 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 SPNP16150 400 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
ATG4D-210ENST00000588972 SYNJ2BPP57105 145 aa5.63□□□□□ -1.51
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