RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.02■□□□□ -0
PPP4C-211ENST00000567642 CCNKO75909 580 aa15.01□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 METTL15P1P0C7V9 234 aa15.01□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 BTCP35070 178 aa15.01□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 IGFL4Q6B9Z1 124 aa15.01□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 HIGD1AQ9Y241 93 aa15.01□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 DNAH10Q8IVF4 4471 aa15.01□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 PMS2P5A8MQ11 134 aa15□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 HYPMO75409 117 aa15□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 AMBPP02760 352 aa15□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 OR5G3P0C626 314 aa15□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf158Q8N1D5 194 aa15□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 C17orf77Q96MU5 243 aa15□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 GSKIPQ9P0R6 139 aa15□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 H3BRN7 92 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 HBE1P02100 147 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 LINC00869P0C866 280 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 IL7P13232 177 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 DLK1P80370 383 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.99□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 SELENOTP62341 195 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 RNF182Q8N6D2 247 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 DKK2Q9UBU2 259 aa14.98□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 RRN3P1Q2M238 152 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF738Q8NE65 137 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 UHRF2Q96PU4 802 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 ARL6Q9H0F7 186 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.97□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 P0DMU3 169 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 FAM231AP0DMU4 169 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 FAM231CP0DMU5 169 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 HTN3P15516 51 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 AMTNQ6UX39 209 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 S100A7AQ86SG5 101 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 MITD1Q8WV92 249 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.96□□□□□ -0.01
PPP4C-211ENST00000567642 A8MTW9 85 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 TSC22D2O75157 780 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 PLP1P60201 277 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 TEPPQ6URK8 271 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 FNDC10F2Z333 226 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 M0R2Z0 102 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 CCSO14618 274 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 TAS2R30P59541 319 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF846Q147U1 533 aa14.94□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 L7N2F9 121 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 GOSR2O14653 212 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 PLA2G10O15496 165 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 LYRM1O43325 122 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 INSP01308 110 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 VAMP2P63027 116 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARV1Q9H2C2 271 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.93□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 C7orf66A4D0T2 115 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 FAM25EA8MYX2 175 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 RHOBP62745 196 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARL16Q0P5N6 197 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 PATE2Q6UY27 113 aa14.92□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 A0A087X0K7 114 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 AGPAT2O15120 278 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 DAD1P61803 113 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF546Q86UE3 836 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 RNF24Q9Y225 148 aa14.91□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.9□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 K7EPK0 472 aa14.9□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PPP4C-211ENST00000567642 TCRBP04435 133 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 296.8 ms