RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.51□□□□□ -0.09
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CMTM3-211ENST00000565922 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
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CMTM3-211ENST00000565922 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.45□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.45□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.45□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 PFDN5Q99471 154 aa14.45□□□□□ -0.1
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CMTM3-211ENST00000565922 PATE2Q6UY27 113 aa14.44□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.44□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 C11orf45Q8TAV5 145 aa14.44□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.44□□□□□ -0.1
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CMTM3-211ENST00000565922 PRR20DP86480 221 aa14.42□□□□□ -0.1
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CMTM3-211ENST00000565922 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.42□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 C17orf77Q96MU5 243 aa14.42□□□□□ -0.1
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CMTM3-211ENST00000565922 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.41□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.41□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 C20orf173Q96LM9 149 aa14.41□□□□□ -0.1
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CMTM3-211ENST00000565922 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.41□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 X6R8D5 127 aa14.41□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 F6UB75 175 aa14.4□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF738Q8NE65 137 aa14.4□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.4□□□□□ -0.1
CMTM3-211ENST00000565922 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.39□□□□□ -0.11
CMTM3-211ENST00000565922 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CMTM3-211ENST00000565922 DEFB4AO15263 64 aa14.39□□□□□ -0.11
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