RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 SVIPQ8NHG7 77 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 TMED6Q8WW62 240 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 GLMPQ8WWB7 406 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 RNF2Q99496 336 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 RPRMQ9NS64 109 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF320A2RRD8 509 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 H3BRN7 92 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 OVOL1O14753 267 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 CHEK1O14757 476 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 CYB5BO43169 146 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 DFFBO76075 338 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 FOLR2P14207 255 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 ORM2P19652 201 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 CBLN1P23435 193 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 B2MP61769 119 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 SMPXQ9UHP9 88 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 H3BTX0 84 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 SLC17A3O00476 420 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 TAAR5O14804 337 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 BUB3O43684 328 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 MPDU1O75352 247 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 OR5G3P0C626 314 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 PYYP10082 97 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 GP9P14770 177 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 ZP3P21754 424 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 DEFB1P60022 68 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP10-11P60412 298 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF266Q14584 549 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 Q6ZSN1 163 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 DPF1Q92782 380 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 SLC25A22Q9H936 323 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.22□□□□□ -1.41
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF98A6NK75 572 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 G3V4G9 280 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 H3BQ15 152 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 K7EMT4 169 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 SOCS3O14543 225 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 JTBO76095 146 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 IFNA5P01569 189 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 IGLV1-51P01701 117 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 HLA-DMBP28068 263 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 ICAM4Q14773 271 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 SLC51BQ86UW2 128 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 BAP18Q8IXM2 172 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 Q8WTZ3 238 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 OR4F4Q96R69 305 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF785A8K8V0 405 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 HYPMO75409 117 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFB4O95168 129 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 IGLC2P0DOY2 106 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 SELENOTP62341 195 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 CCL20P78556 96 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 FAM78BQ5VT40 261 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 FXYD5Q96DB9 178 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 C20orf173Q96LM9 149 aa6.2□□□□□ -1.42
TMOD3-211ENST00000561438 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.4 ms