RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IFNA5P01569 189 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF709Q8N972 641 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CITED4Q96RK1 184 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 G3V3Q6 166 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MEOX2P50222 304 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LEMD1Q68G75 181 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q6ZNX1 250 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SOCS3O14543 225 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF688P0C7X2 276 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSMB3P49720 205 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFB131AP59861 70 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF266Q14584 549 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HAGHQ16775 308 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ASCL2Q99929 193 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AGRNO00468 2067 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF222A6NCQ9 220 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ISLRO14498 428 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ID1P41134 155 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF124Q15973 351 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSMG4Q5JS54 123 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RSG1Q9BU20 258 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WFDC1Q9HC57 220 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A087X0K7 114 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APOC4P55056 127 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C17orf77Q96MU5 243 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZMAT4Q9H898 229 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMLR1H3BR10 107 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARPC5O15511 151 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MORN5Q5VZ52 161 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C16orf92Q96LL3 132 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPATA25Q9BR10 227 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CXCL2P19875 107 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM78BQ5VT40 261 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LCN15Q6UWW0 184 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STHQ8IWL8 128 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HMSDA8MTL9 139 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBE2CO00762 179 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGLC2P0DOY2 106 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF345Q14585 488 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00052Q96N35 136 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MFFQ9GZY8 342 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HRH4Q9H3N8 390 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 U3KQK5 164 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KNCNA6PVL3 124 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAAR5O14804 337 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GUK1Q16774 197 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RCHY1Q96PM5 261 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPRMQ9NS64 109 aa9.49□□□□□ -0.89
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