RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545331.5

TULP3-208, Transcript of tubby like protein 3, human

TSL 2

Gene TULP3, Length 1,373 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TULP3-208	ENST00000545331	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	UBE2C	O00762	179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	ID1	P41134	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	UHRF2	Q96PU4	802 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331		U3KQK5	164 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	ISLR	O14498	428 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	PSMB3	P49720	205 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF709	Q8N972	641 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	SOCS3	O14543	225 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	IFNA5	P01569	189 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.58	□□□□□ -0.23
TULP3-208	ENST00000545331	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	STH	Q8IWL8	128 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331		A0A087X0K7	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF266	Q14584	549 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF124	Q15973	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331		Q6ZWC4	215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	CXCL2	P19875	107 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331		Q5BKY6	102 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	COL7A1	Q02388	2944 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	SPP1	P10451	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TULP3-208	ENST00000545331	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331		G3V3Q6	166 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	GUK1	Q16774	197 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	FAM78B	Q5VT40	261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	AGRN	O00468	2067 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331		H3BMM0	161 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF253	O75346	499 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	RNF183	Q96D59	192 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	SPRY2	O43597	315 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TULP3-208	ENST00000545331	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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