RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	HBE1	P02100	147 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	THAP8	Q8NA92	274 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0J9YX75	114 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CCS	O14618	274 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	HTN3	P15516	51 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MEOX2	P50222	304 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MITD1	Q8WV92	249 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MED6	O75586	246 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	IL5	P05113	134 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A6	P12236	298 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	GALR1	P47211	349 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	OXA1L	Q15070	435 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	C20orf173	Q96LM9	149 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	RSG1	Q9BU20	258 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	DOK5	Q9P104	306 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	WRB	O00258	174 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SYNGR2	O43760	224 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PTTG1	O95997	202 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ORM2	P19652	201 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	DAD1	P61803	113 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	RNF212	Q495C1	297 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777		A8MTW9	85 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZR54	194 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	GPR82	Q96P67	336 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	S100A7	P31151	101 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	AKR1C1	Q04828	323 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ALG5	Q9Y673	324 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PKD1	P98161	4303 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PKHD1	P08F94	4074 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	C7orf66	A4D0T2	115 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SIX6	O95475	246 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PRM2	P04554	102 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	FGL1	Q08830	312 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777		H3BP45	60 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777		M0R2Z0	102 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	PRAF2	O60831	178 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	INS	P01308	110 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	RGS21	Q2M5E4	152 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.34	□□□□□ -0.59
DDX11-222	ENST00000542777	SMCO3	A2RU48	225 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DDX11-222	ENST00000542777	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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