RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC25A4	P12235	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	P2RY1	P47900	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A087WXM4	84 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	IGLL5	B9A064	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552		H7C423	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	IFNA17	P01571	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552		P0DMU3	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	C4BPB	P20851	252 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	UCP1	P25874	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	OPRK1	P41145	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	HTR2B	P41595	481 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PIGP	P57054	158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SPCS3	P61009	180 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZRP5	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	AP3S1	Q92572	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CDS2	O95674	445 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CD74	P04233	296 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PGAM2	P15259	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ELK1	P19419	428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TGFBR1	P36897	503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	DHRS2	Q13268	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GVY2	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFB4A	O15263	64 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	CD3D	P04234	171 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	NPY1R	P25929	384 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10J1	P30954	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ETV6	P41212	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	RORC	P51449	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS2R19	P59542	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	MEF2D	Q14814	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PDE4D-222	ENST00000514552		Q8WTZ3	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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