RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP2-225ENST00000513069 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP2-225ENST00000513069 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP2-225ENST00000513069 Q6ZRG5 221 aa11.07□□□□□ -0.64
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SH3BP2-225ENST00000513069 A8MTW9 85 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-225ENST00000513069 IGKV3-20P01619 116 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-225ENST00000513069 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM78BQ5VT40 261 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-225ENST00000513069 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF709Q8N972 641 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-225ENST00000513069 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-225ENST00000513069 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-225ENST00000513069 RPRMQ9NS64 109 aa11.04□□□□□ -0.64
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