RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505399.2

FBXO38-209, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 5

Gene FBXO38, Length 843 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-209	ENST00000505399	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399		Q9H3A6	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399		S4R3C0	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399		C9JQL5	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF253	O75346	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	S100A8	P05109	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	CTSG	P08311	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	PYY	P10082	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	BLCAP	P62952	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	FOXE3	Q13461	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-209	ENST00000505399	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399		A8MWL6	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399		P01737	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	IGHG4	P01861	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	AMY1A	P04745	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	RAB5A	P20339	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	NDP	Q00604	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	TNC	P24821	2201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399		A0A096LNT2	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399		K7EMT4	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	ISLR	O14498	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	OVOL1	O14753	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	TCRA	P04437	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	FOXL1	Q12952	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-209	ENST00000505399	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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