RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497700.1

ELL3-208, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 3

Gene ELL3, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-208	ENST00000497700	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	GUCA2B	Q16661	112 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	TIGIT	Q495A1	244 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700		Q56UQ5	140 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	ATP6V0B	Q99437	205 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	FABP1	P07148	127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	OR2C1	O95371	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	TOMM40	O96008	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	CTSG	P08311	255 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	FOLR2	P14207	255 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	PLP1	P60201	277 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	CLEC3B	P05452	202 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	RD3L	P0DJH9	198 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	PSG1	P11464	419 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700		A0A1W2PPV4	95 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	HBE1	P02100	147 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	GPR183	P32249	361 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	ADM	P35318	185 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	RHOB	P62745	196 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	PFDN5	Q99471	154 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	RNF2	Q99496	336 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ELL3-208	ENST00000497700	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	TGOLN2	O43493	480 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	COX7A2P2	O60397	106 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	OR5G3	P0C626	314 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700		Q8WTZ3	238 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	HYPM	O75409	117 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	FAM78B	Q5VT40	261 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	DOK5	Q9P104	306 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	MLX	Q9UH92	298 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	ORM2	P19652	201 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	CCL20	P78556	96 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	FAM209B	Q5JX69	171 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700		A0A1B0GV50	99 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	CBLN1	P23435	193 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ELL3-208	ENST00000497700	LYZ	P61626	148 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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