RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 MIC13Q5XKP0 118 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 GPHB5Q86YW7 130 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF747Q9BV97 191 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ATRQ13535 2644 aa7.45□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF320A2RRD8 509 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 A8MWP6 167 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 CCL24O00175 119 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 LGALS9O00182 355 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 OR5G3P0C626 314 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 MYCNOSP40205 109 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 RAB2AP61019 212 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 KHDC3LQ587J8 217 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 TEX261Q6UWH6 196 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 DOK5Q9P104 306 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.44□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WWL8 130 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PS18 150 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 MARC2Q969Z3 335 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 C8orf49Q96NF6 230 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 K7EMT4 169 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 CD5P06127 495 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 NPPCP23582 126 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SULT1A2P50226 295 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SYNJ2BPP57105 145 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 RAB14P61106 215 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 FAM78BQ5VT40 261 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 GPR82Q96P67 336 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A22Q9H936 323 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 FUT9Q9Y231 359 aa7.42□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 H3BRN7 92 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 OVOL1O14753 267 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 HBE1P02100 147 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 CRYBB3P26998 211 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP10-3P60369 221 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 HELTA6NFD8 242 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 OR7C2O60412 319 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 GALR1P47211 349 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 MEOX2P50222 304 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 BLOC1S1P78537 153 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 DUX3Q96PT4 197 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 UHRF2Q96PU4 802 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 RPRMQ9NS64 109 aa7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM213A2RRL7 107 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-211ENST00000497210 C2orf70A6NJV1 201 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF98A6NK75 572 aa7.39□□□□□ -1.23
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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