RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV4-39	P01824	125 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYGS	P22914	178 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf82	Q6UX34	121 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIO	O75962	3097 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	RUNX3	Q13761	415 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMN1	Q8IY45	258 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF524	Q96C55	264 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	C12orf77	C9JDV5	145 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00694	P0DN24	101 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF415	Q09FC8	603 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	UCN2	Q96RP3	112 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TDH	Q8IZJ6	230 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	NABP1	Q96AH0	204 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBD6	Q96DN6	1003 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PROCR	Q9UNN8	238 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	UQCRQ	O14949	82 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGFBP4	P22692	258 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q9H3A6	140 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WX48	190 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	C15orf61	A6NNL5	157 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLK10	O43240	276 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFA7	O95182	113 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV2-8	P01709	118 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	MEOX1	P50221	254 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR20E	P86478	221 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR20C	P86479	221 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR20D	P86480	221 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR20B	P86481	221 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR20A	P86496	221 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM219	Q86XT9	240 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB123	Q8N688	67 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	HERVK_113	P63121	156 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL13	O43927	109 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ORM1	P02763	201 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYZ	P61626	148 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	CALY	Q9NYX4	217 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TCRA	P04437	139 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BTX0	84 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	OTOR	Q9NRC9	128 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549		H7C1H1	209 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBP4	P02753	201 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	EML5	Q05BV3	1969 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM213	A2RRL7	107 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-13	P01766	116 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-DMB	P28068	263 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	MDP1	Q86V88	176 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP5G1	P05496	136 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-DRB4	P13762	266 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYOD1	P15172	320 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	LTBR	P36941	435 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD69	Q07108	199 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRG2	O14669	202 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	BRI3	O95415	125 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL9A1	P20849	921 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZSR3	168 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF714	Q96N38	554 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLK15	Q9H2R5	256 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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