RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	VWC2L	B2RUY7	222 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	RASL11A	Q6T310	242 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	PCP2	Q8IVA1	136 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	OR4A5	Q8NH83	315 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FXYD5	Q96DB9	178 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXL15	Q9H469	300 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	C21orf140	B9A014	251 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	SEC11A	P67812	179 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FMC1	Q96HJ9	113 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	7.92	□□□□□ -1.14	6e-31	■■■■■ 113.8
ERCC3-208	ENST00000491292	IL4	P05112	153 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM106CP	P0CH98	169 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	F2RL2	O00254	374 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	TGFA	P01135	160 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM27E3	Q08E93	113 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	C10orf142	B7Z368	130 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	COX8A	P10176	69 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	RPE	Q96AT9	228 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXC2	Q99958	501 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	PSG3	Q16557	428 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	C17orf77	Q96MU5	243 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	PSG8	Q9UQ74	426 aa		7.91	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PPI3	338 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	VSTM5	A8MXK1	200 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLC1	P0CG04	106 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	CNTFR	P26992	372 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	RHOG	P84095	191 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	MBD6	Q96DN6	1003 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	C1RL	Q9NZP8	487 aa		7.9	□□□□□ -1.14
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.9	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF785	A8K8V0	405 aa		7.9	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		7.9	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	AMTN	Q6UX39	209 aa		7.9	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	ORMDL3	Q8N138	153 aa		7.9	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292		Q8TAT8	98 aa		7.9	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		7.9	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	HSD52	Q0P140	79 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	FOXE3	Q13461	319 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	MSMP	Q1L6U9	139 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF747	Q9BV97	191 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	DKK2	Q9UBU2	259 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	PRR33	A8MZF0	331 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV3-15	P01624	115 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	PPBP	P02775	128 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	DDB2	Q92466	427 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BVH4	76 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	HBD	P02042	147 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	LEP	P41159	167 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292		Q86TA4	180 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	SIGMAR1	Q99720	223 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
ERCC3-208	ENST00000491292	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		7.88	□□□□□ -1.15

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