RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	DOK5	Q9P104	306 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	KLK11	Q9UBX7	282 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.85	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF98	A6NK75	572 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	RS1	O15537	224 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	IL4	P05112	153 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	GNAO1	P09471	354 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	HSMCR30	P0CW71	290 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	VPREB1	P12018	145 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	MYL9	P24844	172 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	CDKN1B	P46527	198 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	TAS2R60	P59551	318 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	FXYD4	P59646	89 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	ASAH1	Q13510	395 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	TDRG1	Q3Y452	100 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	NOXA1	Q86UR1	476 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM17	Q86X19	198 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	HOGA1	Q86XE5	327 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	FAM219A	Q8IW50	185 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	UHRF2	Q96PU4	802 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CEP170-216	ENST00000490813	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813		A0A0A6YYH2	397 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM235	A6NFC5	223 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813		A6NJ64	397 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	GPR31	O00270	319 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	PSCA	O43653	123 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	IGKV1-17	P01599	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	FABP1	P07148	127 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	RD3L	P0DJH9	198 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	RAB3B	P20337	219 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	EVI2A	P22794	236 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	HTR2B	P41595	481 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	FABP5	Q01469	135 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	DHODH	Q02127	395 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	SLA	Q13239	276 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	SEC22A	Q96IW7	307 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	LINC01587	Q99440	93 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	MGLL	Q99685	303 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	VCX	Q9H320	206 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	VCX3B	Q9H321	246 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	NUDT15	Q9NV35	164 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813		A0A0J9YY99	117 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	CTDSPL	O15194	276 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	TOMM40	O96008	361 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	RLN2	P04090	185 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	IGLC1	P0CG04	106 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	OR10J1	P30954	320 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	RAP2B	P61225	183 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	TIGIT	Q495A1	244 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	MLST8	Q9BVC4	326 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	DUSP21	Q9H596	190 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813		H7BYZ3	331 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	NXPH4	O95158	308 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	APOA1	P02647	267 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	GALR1	P47211	349 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CEP170-216	ENST00000490813	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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