RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490203.5

ELF3-208, Transcript of E74 like ETS transcription factor 3, human

TSL 5

Gene ELF3, Length 885 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELF3-208	ENST00000490203	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	GPR82	Q96P67	336 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203		U3KQE9	123 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	BUB3	O43684	328 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	CD5	P06127	495 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	HELT	A6NFD8	242 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	EDN2	P20800	178 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	FHIT	P49789	147 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	BLOC1S1	P78537	153 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	TCF24	Q7RTU0	167 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	CXorf1	O96002	111 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	GLMP	Q8WWB7	406 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	MLX	Q9UH92	298 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ELF3-208	ENST00000490203	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	HBE1	P02100	147 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	INSL3	P51460	131 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	RAB14	P61106	215 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	PAFAH1B2	P68402	229 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF726P1	Q15940	193 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203		A0A1B0GV50	99 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	PYY	P10082	97 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	GCHFR	P30047	84 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	MEOX2	P50222	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	OR10J4	P0C629	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	GP9	P14770	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	IGLL1	P15814	213 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	TFPI2	P48307	235 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	IFITM2	Q01629	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	GUK1	Q16774	197 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203		A0A087X0K7	114 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	TSPAN4	O14817	238 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	IGLV1-51	P01701	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ELF3-208	ENST00000490203	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.1	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms