RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 DAD1P61803 113 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 MCFD2Q8NI22 146 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 OR11H7Q8NGC8 314 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 RYR1P21817 5038 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 HOXB5P09067 269 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 B2MP61769 119 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R1AQ13522 171 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 PYDC2Q56P42 97 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 LYRM9A8MSI8 78 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 AKR1C1Q04828 323 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 V9GYH0 126 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 H3BRN7 92 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 INSP01308 110 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 TSPOP30536 169 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 ID3Q02535 119 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 H3BP45 60 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 M0R2Z0 102 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 PLP1P60201 277 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF182Q8N6D2 247 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 PRM2P04554 102 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 IL5P05113 134 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 RAP2BP61225 183 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 FGL1Q08830 312 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 HYPMO75409 117 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 SELENOTP62341 195 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 BAP18Q8IXM2 172 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF738Q8NE65 137 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 PSENENQ9NZ42 101 aa11.67□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A087X0K7 114 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 C9orf170A2RU37 121 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 SMCO3A2RU48 225 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 ADAP1O75689 374 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 AZU1P20160 251 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 S100A5P33763 92 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 S100A7AQ86SG5 101 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC190Q86UF4 302 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 ATG101Q9BSB4 218 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 FNDC10F2Z333 226 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 DEFB130BP0DP73 79 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 DEFB130AP0DP74 79 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 CXCL3P19876 107 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 PSG3Q16557 428 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 SMIM8Q96KF7 97 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-210ENST00000489601 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.65□□□□□ -0.54
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SH3BP4-210ENST00000489601 OR5G3P0C626 314 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC00869P0C866 280 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 TAS2R60P59551 318 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 RHOBP62745 196 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 DLK1P80370 383 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 FCN2Q15485 313 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF575Q86XF7 245 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 UHRF2Q96PU4 802 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC01587Q99440 93 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF24Q9Y225 148 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 CBY3A6NI87 242 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 F5H768 121 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 NDUFB6O95139 128 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP5G1P05496 136 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP5G3P48201 142 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.63□□□□□ -0.55
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