RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 RAP2BP61225 183 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 CLINT1Q14677 625 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 HAGHQ16775 308 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 MIC13Q5XKP0 118 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 LEMD1Q68G75 181 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 THAP6Q8TBB0 222 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 ARV1Q9H2C2 271 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 TUBA4BQ9H853 241 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 FBXL17Q9UF56 701 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.54□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 OR5G3P0C626 314 aa9.53□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 ZNF688P0C7X2 276 aa9.53□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.53□□□□□ -0.88
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SSR4-211ENST00000486204 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.53□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 SLC25A22Q9H936 323 aa9.53□□□□□ -0.88
SSR4-211ENST00000486204 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 MORN5Q5VZ52 161 aa9.52□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 AQP10Q96PS8 301 aa9.52□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 WFDC1Q9HC57 220 aa9.52□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.52□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.52□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 B2MP61769 119 aa9.51□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 FGL1Q08830 312 aa9.51□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.51□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 GPR82Q96P67 336 aa9.51□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.51□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.5□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.5□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.5□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 PSMG4Q5JS54 123 aa9.49□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.49□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZNX1 250 aa9.49□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZRG5 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 IL17DQ8TAD2 202 aa9.49□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 ISLRO14498 428 aa9.48□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 PSMB3P49720 205 aa9.48□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 MEOX2P50222 304 aa9.48□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 SPATA25Q9BR10 227 aa9.48□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 RFNGQ9Y644 331 aa9.48□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.47□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.47□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.47□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 KNCNA6PVL3 124 aa9.47□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 SMLR1H3BR10 107 aa9.47□□□□□ -0.89
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SSR4-211ENST00000486204 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.46□□□□□ -0.89
SSR4-211ENST00000486204 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.46□□□□□ -0.9
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SSR4-211ENST00000486204 APOC4P55056 127 aa9.46□□□□□ -0.9
SSR4-211ENST00000486204 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.46□□□□□ -0.9
SSR4-211ENST00000486204 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.46□□□□□ -0.9
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SSR4-211ENST00000486204 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.46□□□□□ -0.9
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SSR4-211ENST00000486204 ID1P41134 155 aa9.45□□□□□ -0.9
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