RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF688	P0C7X2	276 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	GALR1	P47211	349 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	DEFB131A	P59861	70 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	LEMD1	Q68G75	181 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	C17orf77	Q96MU5	243 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	PFDN5	Q99471	154 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	PSMB3	P49720	205 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	MEOX2	P50222	304 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF124	Q15973	351 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887		Q6ZRG5	221 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	WFDC1	Q9HC57	220 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887		A0A087X0K7	114 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	RNF222	A6NCQ9	220 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	ISLR	O14498	428 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	IFNA5	P01569	189 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	PSMG4	Q5JS54	123 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	MORN5	Q5VZ52	161 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	SPATA25	Q9BR10	227 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	RSG1	Q9BU20	258 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	ZMAT4	Q9H898	229 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		7	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	ID1	P41134	155 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	APOC4	P55056	127 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF266	Q14584	549 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887		Q6ZNX1	250 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF709	Q8N972	641 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	RCHY1	Q96PM5	261 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887		U3KQK5	164 aa		6.99	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	KNCN	A6PVL3	124 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	UBE2C	O00762	179 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	IGLC2	P0DOY2	106 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	CXCL2	P19875	107 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	HLA-DRB4	P13762	266 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	FAM78B	Q5VT40	261 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	LCN15	Q6UWW0	184 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887		Q6ZWC4	215 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	STH	Q8IWL8	128 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	C16orf92	Q96LL3	132 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	RETN	Q9HD89	108 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SFI1-222	ENST00000478887	TG	P01266	2768 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887		H3BMM0	161 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	ARPC5	O15511	151 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	SPP1	P10451	314 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF345	Q14585	488 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	GUK1	Q16774	197 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00052	Q96N35	136 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	CSTL1	Q9H114	145 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	HRH4	Q9H3N8	390 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
SFI1-222	ENST00000478887	RPRM	Q9NS64	109 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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