RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478693.1

SRRT-211, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-211ENST00000478693 ID1P41134 155 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 MEOX2P50222 304 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 DEFB131AP59861 70 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PSMG4Q5JS54 123 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 AKAP14Q86UN6 197 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 DCANP1Q8TF63 244 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 FAM78BQ5VT40 261 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 C16orf92Q96LL3 132 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 LINC00052Q96N35 136 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 ASCL2Q99929 193 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 B9D2Q9BPU9 175 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 A8MZ25 164 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 TAAR5O14804 337 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 PFDN1O60925 122 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 PSMB3P49720 205 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ZNF124Q15973 351 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 MORN5Q5VZ52 161 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 STHQ8IWL8 128 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 FBN3Q75N90 2809 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 A0A1W2PPV4 95 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 HMSDA8MTL9 139 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ISLRO14498 428 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ATP6V0CP27449 155 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RHOBP62745 196 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ZNF345Q14585 488 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 CITED4Q96RK1 184 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ZMAT4Q9H898 229 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 FUT9Q9Y231 359 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 A0A087X0K7 114 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 A0A0D9SG52 128 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 A0A1B0GVG6 124 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 KNCNA6PVL3 124 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 H3BTX0 84 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 OR7C2O60412 319 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 JTBO76095 146 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 M6PRP20645 277 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 APOC4P55056 127 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 TAS2R45P59539 299 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RAB2AP61019 212 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 KHDC3LQ587J8 217 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 LCN15Q6UWW0 184 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ZNF738Q8NE65 137 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RPRMQ9NS64 109 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RFNGQ9Y644 331 aa8.44□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 SOCS3O14543 225 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 BCL2L11O43521 198 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 MBP02144 154 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 C1QBP02746 253 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 PYYP10082 97 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 CXCL2P19875 107 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 HAGHQ16775 308 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 RNF182Q8N6D2 247 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.43□□□□□ -1.06
SRRT-211ENST00000478693 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.43□□□□□ -1.06
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