RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 PRR20EP86478 221 aa13.62□□□□□ -0.23
DDR1-241ENST00000460944 PRR20CP86479 221 aa13.62□□□□□ -0.23
DDR1-241ENST00000460944 PRR20DP86480 221 aa13.62□□□□□ -0.23
DDR1-241ENST00000460944 PRR20BP86481 221 aa13.62□□□□□ -0.23
DDR1-241ENST00000460944 PRR20AP86496 221 aa13.62□□□□□ -0.23
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DDR1-241ENST00000460944 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.62□□□□□ -0.23
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DDR1-241ENST00000460944 ATP5SQ99766 215 aa13.62□□□□□ -0.23
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DDR1-241ENST00000460944 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
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DDR1-241ENST00000460944 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa13.54□□□□□ -0.24
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DDR1-241ENST00000460944 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.53□□□□□ -0.24
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DDR1-241ENST00000460944 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.53□□□□□ -0.24
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DDR1-241ENST00000460944 LCN15Q6UWW0 184 aa13.52□□□□□ -0.25
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DDR1-241ENST00000460944 ZNF738Q8NE65 137 aa13.5□□□□□ -0.25
DDR1-241ENST00000460944 C20orf173Q96LM9 149 aa13.5□□□□□ -0.25
DDR1-241ENST00000460944 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.49□□□□□ -0.25
DDR1-241ENST00000460944 IGLC2P0DOY2 106 aa13.49□□□□□ -0.25
DDR1-241ENST00000460944 DEFB1P60022 68 aa13.49□□□□□ -0.25
DDR1-241ENST00000460944 GUK1Q16774 197 aa13.49□□□□□ -0.25
DDR1-241ENST00000460944 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.49□□□□□ -0.25
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