RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB130AP0DP74 79 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A6P12236 298 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF79Q15937 498 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF709Q8N972 641 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF738Q8NE65 137 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ATG101Q9BSB4 218 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SSSCA1O60232 199 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 HYPMO75409 117 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAP1O75689 374 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 INSP01308 110 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 PAX9P55771 341 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIQKQ629K1 86 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 LRTM2Q8N967 370 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR82Q96P67 336 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01587Q99440 93 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 NACAE9PAV3 2078 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 C9orf170A2RU37 121 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 F5H768 121 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 NUDT3O95989 172 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 FCN2Q15485 313 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 C4orf46Q504U0 113 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 S100A7AQ86SG5 101 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM63Q969Q1 353 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM210BQ96KR6 192 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ARL6Q9H0F7 186 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 V9GYH0 126 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 CENPXA8MT69 81 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 GOSR2O14653 212 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 RTL8CO15255 209 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 CCNKO75909 580 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00869P0C866 280 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 ID3Q02535 119 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 OXA1LQ15070 435 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 BAP18Q8IXM2 172 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 UHRF2Q96PU4 802 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC4Q99102 2169 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 PRSS46E5RG02 174 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BRN7 92 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 L7N2F9 121 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4E1P0C645 316 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 AZU1P20160 251 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 B2MP61769 119 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 SELENOTP62341 195 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 VAMP2P63027 116 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 PSG3Q16557 428 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF212Q495C1 297 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 TEPPQ6URK8 271 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 AMTNQ6UX39 209 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC190Q86UF4 302 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM8Q96KF7 97 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 LYRM9A8MSI8 78 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM25EA8MYX2 175 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BTX0 84 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 J3KRW8 73 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 COX7A2P2O60397 106 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFB6O95139 128 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1-204ENST00000459646 BCAP31P51572 246 aa6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms