RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMCO3A2RU48 225 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ISLRO14498 428 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ORM2P19652 201 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEOX2P50222 304 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NHLH2Q02577 135 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 S100A7AQ86SG5 101 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.24□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RYR3Q15413 4870 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GALR1P47211 349 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAMLGP49069 296 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMB3P49720 205 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAP2BP61225 183 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB31Q13636 194 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OPCMLQ14982 345 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGS21Q2M5E4 152 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AGRNO00468 2067 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A087X0K7 114 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A8MTW9 85 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C3orf84H3BNL1 204 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF688P0C7X2 276 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PET100P0DJ07 73 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ID1P41134 155 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FCN2Q15485 313 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARL6Q9H0F7 186 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARV1Q9H2C2 271 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H3BMM0 161 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPRY2O43597 315 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPP1P10451 314 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HLA-DRB4P13762 266 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMG4Q5JS54 123 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LEMD1Q68G75 181 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZRG5 221 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UHRF2Q96PU4 802 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RSG1Q9BU20 258 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MED28Q9H204 178 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RETNQ9HD89 108 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR5G3P0C626 314 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MIC13Q5XKP0 118 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STHQ8IWL8 128 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MUC7Q8TAX7 377 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PFDN5Q99471 154 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A22Q9H936 323 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DOK5Q9P104 306 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSPB11Q9Y547 144 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KNCNA6PVL3 124 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLC2P0DOY2 106 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXCL2P19875 107 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 B2MP61769 119 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HRH4Q9H3N8 390 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBD2Q9UBB5 411 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.19□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0J9YX75 114 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FGF7P21781 194 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FGL1Q08830 312 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFB135Q30KP9 77 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.18□□□□□ -1.1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MORN5Q5VZ52 161 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms