RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	PSMB3	P49720	205 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB131A	P59861	70 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	B2M	P61769	119 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5S	Q99766	215 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	COX7A2P2	O60397	106 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	PATE2	Q6UY27	113 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZNX1	250 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZWC4	215 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	RCHY1	Q96PM5	261 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	DOK5	Q9P104	306 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087X0K7	114 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	SOCS3	O14543	225 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	CLINT1	Q14677	625 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	AGRN	O00468	2067 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	IFNA5	P01569	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	CXCL2	P19875	107 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	MIC13	Q5XKP0	118 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	STH	Q8IWL8	128 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	AQP10	Q96PS8	301 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	UHRF2	Q96PU4	802 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	SPP1	P10451	314 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	LEMD1	Q68G75	181 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	RSG1	Q9BU20	258 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	CSTL1	Q9H114	145 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF266	Q14584	549 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF124	Q15973	351 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	GUK1	Q16774	197 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	RNF183	Q96D59	192 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241		H3BMM0	161 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	SPRY2	O43597	315 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF253	O75346	499 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	PFDN1	O60925	122 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241		Q5BKY6	102 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241		A8MTW9	85 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241		G3V3Q6	166 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	PDE6H	Q13956	83 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB135	Q30KP9	77 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PTPA-222	ENST00000445241	WFDC1	Q9HC57	220 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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