RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 SOCS3O14543 225 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 OPCMLQ14982 345 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 SCRT1Q9BWW7 348 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 ISLRO14498 428 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMB3P49720 205 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMG4Q5JS54 123 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 MIC13Q5XKP0 118 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 STHQ8IWL8 128 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM37Q8WXS4 190 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 UHRF2Q96PU4 802 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 RSG1Q9BU20 258 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 MBD2Q9UBB5 411 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 COX7A2P2O60397 106 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF7P21781 194 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL12P30050 165 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00305Q7Z4B0 112 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1L4Q8NGR5 311 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 THAP6Q8TBB0 222 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 C17orf77Q96MU5 243 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 RETNQ9HD89 108 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC39A9Q9NUM3 307 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPB11Q9Y547 144 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-204ENST00000442563 GIPP09681 153 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 B2MP61769 119 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 FGL1Q08830 312 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 C10orf113Q5VZT2 155 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 PFDN5Q99471 154 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 NPCDR1Q9BY65 106 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A087X0K7 114 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 KNCNA6PVL3 124 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 SPRY2O43597 315 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 CLINT1Q14677 625 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM41BQ5BJD5 291 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTL10Q5JWF8 245 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 GATAD1Q8WUU5 269 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF183Q96D59 192 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00052Q96N35 136 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP5SQ99766 215 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 PXMP4Q9Y6I8 212 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 SPP1P10451 314 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 C16orf92Q96LL3 132 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNIP2Q9NS61 270 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BMM0 161 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB135Q30KP9 77 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF709Q8N972 641 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNA5P01569 189 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 HLA-DRB4P13762 266 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 RPRMQ9NS64 109 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 C17orf112F2Z3M2 114 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 CA1P00915 261 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 CXCL2P19875 107 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 MORN5Q5VZ52 161 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 SCGB1C1Q8TD33 95 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 AQP10Q96PS8 301 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.33□□□□□ -0.43
RABGEF1-204ENST00000442563 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 C3orf84H3BNL1 204 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 Q5BKY6 102 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 EBLN2Q6P2I7 272 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 C20orf173Q96LM9 149 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM3Q9BZL3 60 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 HRH4Q9H3N8 390 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TENM3Q9P273 2699 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLC2P0DOY2 106 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 GUK1Q16774 197 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 GDF5OSQ5U4N7 250 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 LCN15Q6UWW0 184 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 MUC7Q8TAX7 377 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 WFDC1Q9HC57 220 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV5A0A0B4J249 113 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0J9YX75 114 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC20Q8TCA0 184 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC50A1Q9BRV3 221 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms