RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 METTL26Q96S19 204 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ZFP92A6NM28 416 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN4O14817 238 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1-17P01599 117 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 NPPCP23582 126 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 RNF183Q96D59 192 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 IL4P05112 153 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V0CP27449 155 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TEPPQ6URK8 271 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 STOML3Q8TAV4 291 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 MGST2Q99735 147 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 RSG1Q9BU20 258 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 RABAC1Q9UI14 185 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 KMT2AQ03164 3969 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PS18 150 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 MPDU1O75352 247 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TOMM40O96008 361 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 RD3LP0DJH9 198 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 PAFAH1B2P68402 229 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 BAP18Q8IXM2 172 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ZNF709Q8N972 641 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 THAP8Q8NA92 274 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ARV1Q9H2C2 271 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 RFNGQ9Y644 331 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 AGPAT2O15120 278 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 CAMLGP49069 296 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 LYZP61626 148 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 RAB31Q13636 194 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 CD5P06127 495 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 FABP1P07148 127 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 SPP1P10451 314 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 PSG1P11464 419 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ZNF90Q03938 601 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 MIC13Q5XKP0 118 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TMED6Q8WW62 240 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TRGV9Q99603 122 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 VSIRQ9H7M9 311 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 CRYBB3P26998 211 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 B2MP61769 119 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 ZNF124Q15973 351 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 RNF125Q96EQ8 232 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 RARRES2Q99969 163 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 C11orf94C9JXX5 98 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 SEC11BP0C7V7 166 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 LINC00869P0C866 280 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 IFITM2Q01629 132 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms