RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439079.1

LINC00415-201, long intergenic non-protein coding RNA 415, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00415, Length 435 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00415-201ENST00000439079 IGHV3-11P01762 117 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 UCHL1P09936 223 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 PATE4P0C8F1 98 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 REG3AQ06141 175 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF876PQ49A33 203 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF429Q86V71 674 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 THTPAQ9BU02 230 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.41□□□□□ -1.86
LINC00415-201ENST00000439079 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 C9JAW5 83 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 OVOL1O14753 267 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 NRASP01111 189 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 IGLV2-8P01709 118 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 APOC2P02655 101 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 STATHP02808 62 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 OPN1SWP03999 348 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 MAS1P04201 325 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 KDELR1P24390 212 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 OPRK1P41145 380 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 PLCXD2Q0VAA5 305 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 MKXQ8IYA7 352 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 TOMM6Q96B49 74 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 SPIN2AQ99865 258 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 SOSTQ9BQB4 213 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 RYR2Q92736 4967 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 C20orf202A1L168 122 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 DPRXA6NFQ7 191 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 DEFB108AA8MXU0 73 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 F6UZH7 168 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 DPM2O94777 84 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 P0DMU3 169 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 FAM231AP0DMU4 169 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 FAM231CP0DMU5 169 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 GABRA2P47869 451 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 EVX1P49640 407 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF136P52737 540 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 DYNLT1P63172 113 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ATP5G2Q06055 141 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 MPV17L2Q567V2 206 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF778Q96MU6 729 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 TP53RKQ96S44 253 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 A0A096LNT2 108 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 A0A1B0GUV1 79 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 C4orf51C9J302 202 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 H0YGG7 62 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 BMPR1BO00238 502 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 CCL22O00626 93 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 UBE2L6O14933 153 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 OR7C2O60412 319 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 NCR2O95944 276 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 IFNA17P01571 189 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 CD7P09564 240 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 ATP6V0CP27449 155 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 S100A11P31949 105 aa3.38□□□□□ -1.87
LINC00415-201ENST00000439079 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.9 ms