RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 RYR3Q15413 4870 aa5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNURFLB1AK76 121 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 VWC2LB2RUY7 222 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 C22orf46C9J442 243 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYNX1G3V0Z9 82 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 LY6LH3BQJ8 138 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHOX2AO14813 284 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TGFAP01135 160 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMY1AP04745 511 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYNX1P0DP58 116 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 EFNA4P52798 201 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPPP2P59282 170 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYZP61626 148 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM183BQ1AE95 376 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDZD11Q5EBL8 140 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF329Q86UD4 541 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARPC1AQ92747 370 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM68Q96MH6 324 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIST1H2BLQ99880 126 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 LPAR2Q9HBW0 351 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 OTORQ9NRC9 128 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEX22C9J3V5 150 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 E7EUB6 86 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7EN84 100 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 FCN1O00602 326 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNG7O60262 68 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 LY6HO94772 140 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOMM40O96008 361 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRISP2P16562 243 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARF6P62330 175 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAFAH1B2P68402 229 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 CX3CL1P78423 397 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 FXYD3Q14802 87 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 C5orf64Q2M2E5 130 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 CT83Q5H943 113 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 FXYD5Q96DB9 178 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF503Q96F45 646 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 V9GYV3 84 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 VWFP04275 2813 aa4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLC1P0CG04 106 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM106CPP0CH98 169 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 RD3LP0DJH9 198 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 PYYP10082 97 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 GP9P14770 177 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM11P17152 192 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNTFRP26992 372 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB9AP51151 201 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 MFAP4P55083 255 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 PKIAP61925 76 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDE6HQ13956 83 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 PYY3Q5JQD4 70 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 BAGE2Q86Y30 109 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFHR4Q92496 578 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR82Q96P67 336 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF747Q9BV97 191 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPDR1Q9UM22 224 aa4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 A8MWL6 223 aa4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 I3L2K1 104 aa4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC17A3O00476 420 aa4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOX4O94842 621 aa4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P1-201ENST00000437111 P01737 135 aa4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms