RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
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TOP3B-206ENST00000436282 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.88□□□□□ -0.51
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TOP3B-206ENST00000436282 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.87□□□□□ -0.51
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TOP3B-206ENST00000436282 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF785A8K8V0 405 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 C17orf100A8MU93 164 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MC5RP33032 325 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.86□□□□□ -0.51
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TOP3B-206ENST00000436282 H3BRM9 83 aa11.86□□□□□ -0.51
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TOP3B-206ENST00000436282 PAX2Q02962 417 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RITA1Q96K30 269 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf118A6NHY6 69 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 THBDP07204 575 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 NUP37Q8NFH4 326 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 AP1S3Q96PC3 154 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 A6NDN8 102 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FCN3O75636 299 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 LYZP61626 148 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PLXNB1O43157 2135 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 BSNQ9UPA5 3926 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UQCRFS1P47985 274 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FOXC1Q12948 553 aa11.85□□□□□ -0.51
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