RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.72□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.71□□□□□ -1.33
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A0J9YX75 114 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 F6UB75 175 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MED6O75586 246 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 P0DMU3 169 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM231AP0DMU4 169 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM231CP0DMU5 169 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MEOX2P50222 304 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FXYD7P58549 80 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSG9Q00887 426 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPP1R1AQ13522 171 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PYDC2Q56P42 97 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM78BQ5VT40 261 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DKK2Q9UBU2 259 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RFNGQ9Y644 331 aa6.71□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A1B0GVY2 172 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF98A6NK75 572 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SYNGR2O43760 224 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SFT2D2O95562 160 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EMP1P54849 157 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AMTNQ6UX39 209 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CCDC190Q86UF4 302 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SYT8Q8NBV8 401 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SVIPQ8NHG7 77 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM210BQ96KR6 192 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPRMQ9NS64 109 aa6.7□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 WRBO00258 174 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HOXB5P09067 269 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GALR1P47211 349 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OXA1LQ15070 435 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C16orf92Q96LL3 132 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GPR82Q96P67 336 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC25A22Q9H936 323 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DOK5Q9P104 306 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.69□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H3BP45 60 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RTL8CO15255 209 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HBE1P02100 147 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ORM2P19652 201 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 AKR1C1Q04828 323 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RSG1Q9BU20 258 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C9orf170A2RU37 121 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H3BRN7 92 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ADAP1O75689 374 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 S100A5P33763 92 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RRN3P1Q2M238 152 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SRRQ9GZT4 340 aa6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDUFB6O95139 128 aa6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 S100A7P31151 101 aa6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLP1P60201 277 aa6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 Q6ZR54 194 aa6.66□□□□□ -1.34
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.66□□□□□ -1.34
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