RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 MBP02144 154 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 OR5G3P0C626 314 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 PSG1P11464 419 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 SCGB2A1O75556 95 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV3-11P01762 117 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 FABP1P07148 127 aa7.55□□□□□ -1.2
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ATG4B-211ENST00000429899 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 PATE2Q6UY27 113 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.55□□□□□ -1.2
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ATG4B-211ENST00000429899 SLC25A22Q9H936 323 aa7.55□□□□□ -1.2
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ATG4B-211ENST00000429899 PPP5D1E7EU14 171 aa7.54□□□□□ -1.2
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ATG4B-211ENST00000429899 CLEC3BP05452 202 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 RD3LP0DJH9 198 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ARL3P36405 182 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 FAM209BQ5JX69 171 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.54□□□□□ -1.2
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ATG4B-211ENST00000429899 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 RNF125Q96EQ8 232 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 PFDN5Q99471 154 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 DOK5Q9P104 306 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00862A6NCI5 91 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 H3BRN7 92 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 COX7A2P2O60397 106 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 IL4P05112 153 aa7.53□□□□□ -1.2
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ATG4B-211ENST00000429899 BLOC1S1P78537 153 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 MORN5Q5VZ52 161 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 MED9Q9NWA0 146 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 FUT9Q9Y231 359 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-211ENST00000429899 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
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ATG4B-211ENST00000429899 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 HYPMO75409 117 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 STAG3L2P0CL84 134 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 STAG3L3P0CL85 134 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 RHOBP62745 196 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 FAM78BQ5VT40 261 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.52□□□□□ -1.21
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ATG4B-211ENST00000429899 ZNF575Q86XF7 245 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 Q8WTZ3 238 aa7.52□□□□□ -1.21
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ATG4B-211ENST00000429899 RAB24Q969Q5 203 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 UHRF2Q96PU4 802 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 RNF2Q99496 336 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.52□□□□□ -1.21
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ATG4B-211ENST00000429899 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 LINC01619G3V211 115 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 NDUFA4O00483 81 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 ORM2P19652 201 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 LCN15Q6UWW0 184 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF503Q96F45 646 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-211ENST00000429899 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.51□□□□□ -1.21
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