RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 OR11H2Q8NH07 326 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 IL17DQ8TAD2 202 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RNF126Q9BV68 326 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ARV1Q9H2C2 271 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.81□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB4AO15263 64 aa7.81□□□□□ -1.16
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ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DRB4P13762 266 aa7.81□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DMBP28068 263 aa7.81□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 GALR1P47211 349 aa7.81□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PSMB3P49720 205 aa7.81□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.81□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RARRES2Q99969 163 aa7.81□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.81□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ISLRO14498 428 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 SSNA1O43805 119 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV3-20P01619 116 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 SPP1P10451 314 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 CXCL3P19876 107 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 S100A11P31949 105 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 CAMLGP49069 296 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 FXYD7P58549 80 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RAP2BP61225 183 aa7.8□□□□□ -1.16
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ATG4B-210ENST00000428861 PRR20CP86479 221 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PRR20DP86480 221 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PRR20BP86481 221 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PRR20AP86496 221 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF546Q86UE3 836 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RNF182Q8N6D2 247 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF709Q8N972 641 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 C16orf92Q96LL3 132 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 X6R8D5 127 aa7.8□□□□□ -1.16
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ATG4B-210ENST00000428861 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.79□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 E5RGE8 158 aa7.79□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ID1P41134 155 aa7.79□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 FGL1Q08830 312 aa7.79□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PMS2P11Q13670 270 aa7.79□□□□□ -1.16
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ATG4B-210ENST00000428861 STX12Q86Y82 276 aa7.79□□□□□ -1.16
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ATG4B-210ENST00000428861 A0A0J9YX75 114 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 H3BTX0 84 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 COX7A2P2O60397 106 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 MPC2O95563 127 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PTTG1O95997 202 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 FGF7P21781 194 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 MEOX2P50222 304 aa7.78□□□□□ -1.16
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ATG4B-210ENST00000428861 BAXQ07812 192 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 CLINT1Q14677 625 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 FAM78BQ5VT40 261 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 THAP6Q8TBB0 222 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.78□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.78□□□□□ -1.16
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ATG4B-210ENST00000428861 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 H3BQ15 152 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 RLN2P04090 185 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 B2MP61769 119 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 HBG1P69891 147 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 HBG2P69892 147 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 FCN2Q15485 313 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 ATP6V1FQ16864 119 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 AMTNQ6UX39 209 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.77□□□□□ -1.17
ATG4B-210ENST00000428861 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.77□□□□□ -1.17
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