RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 Q6ZRG5 221 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPRMQ9NS64 109 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CXorf65A6NEN9 183 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H3BRN7 92 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PET100P0DJ07 73 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BAXQ07812 192 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL15RAQ13261 267 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARV1Q9H2C2 271 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGSF23A1L1A6 192 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H3BMM0 161 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGKV3-20P01619 116 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HLA-DRB4P13762 266 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UHRF2Q96PU4 802 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MGST2Q99735 147 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FGF7P21781 194 aa9.08□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PMS2P11Q13670 270 aa9.08□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.08□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PFDN5Q99471 154 aa9.08□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.08□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.08□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SOCS3O14543 225 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MPDU1O75352 247 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTTG1O95997 202 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C4BPBP20851 252 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VWC2Q2TAL6 325 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 XCL2Q9UBD3 114 aa9.07□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 JTBO76095 146 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIFP14174 115 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H2BFSP57053 126 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 B2MP61769 119 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PSG9Q00887 426 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NHLH2Q02577 135 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIC13Q5XKP0 118 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PATE2Q6UY27 113 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF709Q8N972 641 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF738Q8NE65 137 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MFFQ9GZY8 342 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.06□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUPR2A6NF83 97 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FXYD7P58549 80 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB1P60022 68 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLINT1Q14677 625 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM78BQ5VT40 261 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALG5Q9Y673 324 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.05□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A087X0K7 114 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0J9YX75 114 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 F6UB75 175 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB4AO15263 64 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MPC2O95563 127 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CXCL2P19875 107 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRR20EP86478 221 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRR20CP86479 221 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRR20DP86480 221 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRR20BP86481 221 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRR20AP86496 221 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OPCMLQ14982 345 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCN15Q6UWW0 184 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNF182Q8N6D2 247 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THAP6Q8TBB0 222 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C20orf173Q96LM9 149 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MED28Q9H204 178 aa9.04□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TENM2Q9NT68 2774 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms