RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.1□□□□□ -1.59
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CCL20-202ENST00000409189 FUT9Q9Y231 359 aa5.1□□□□□ -1.59
CCL20-202ENST00000409189 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.1□□□□□ -1.59
CCL20-202ENST00000409189 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CCL20-202ENST00000409189 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.09□□□□□ -1.59
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CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PRF3 423 aa5.09□□□□□ -1.59
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PRM7 423 aa5.09□□□□□ -1.59
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CCL20-202ENST00000409189 REG1AP05451 166 aa5.08□□□□□ -1.6
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CCL20-202ENST00000409189 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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CCL20-202ENST00000409189 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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CCL20-202ENST00000409189 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 PRELID1Q9Y255 219 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WWC5 75 aa5.06□□□□□ -1.6
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