RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 PSG1P11464 419 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 LHX2P50458 406 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 MAJINQ3KP22 176 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 MORN2Q502X0 79 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 NABP1Q96AH0 204 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PLXNA2O75051 1894 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-11P01762 117 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 WNT2P09544 360 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 EVI2AP22794 236 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV2-70P01814 119 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FXYD7P58549 80 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF415Q09FC8 603 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 LAGE3Q14657 143 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 CFPP27918 469 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FAM27E3Q08E93 113 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF138P52744 262 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PAX8Q06710 450 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 H3BMM0 161 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ITGB1BP1O14713 200 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FOXF2Q12947 444 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 GUSBP1Q15486 140 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 VCYO14598 125 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf82Q6UX34 121 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 RNF5Q99942 180 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 LEPROTO15243 131 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PSCAO43653 123 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 QRFPP83859 136 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PRCDQ00LT1 54 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 CSRP2Q16527 193 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JRQ6 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 GAGE12BA1L429 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 INSP01308 110 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 NCR2O95944 276 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV1-2P23083 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 BSPH1Q075Z2 132 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZRM9 215 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRM-202ENST00000400053 NPSP0C0P6 89 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 USF3Q68DE3 2245 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ABCA4P78363 2273 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 THADAQ6YHU6 1953 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PRX2 142 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 LYL1P12980 280 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 CD24P25063 80 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 GGNQ86UU5 652 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00205P59089 165 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF876PQ49A33 203 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 RCHY1Q96PM5 261 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PSPNO60542 156 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 CDKN1AP38936 164 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRM-202ENST00000400053 SELLP14151 372 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00477Q96M19 166 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ESDP10768 282 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SS18Q15532 418 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 NUP35Q8NFH5 326 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 GLMPQ8WWB7 406 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.28□□□□□ -1.24
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