RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF709Q8N972 641 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T35Q8NGX2 323 aa11.36□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.36□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNA5P01569 189 aa11.35□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIC13Q5XKP0 118 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PATE2Q6UY27 113 aa11.35□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMAT4Q9H898 229 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A22Q9H936 323 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.35□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMB3P49720 205 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB131AP59861 70 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASCL2Q99929 193 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA25Q9BR10 227 aa11.33□□□□□ -0.6
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LEMD1Q68G75 181 aa11.32□□□□□ -0.6
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZNX1 250 aa11.3□□□□□ -0.6
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C16orf92Q96LL3 132 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 U3KQK5 164 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF222A6NCQ9 220 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 G3V3Q6 166 aa11.29□□□□□ -0.6
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GUK1Q16774 197 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZWC4 215 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WFDC1Q9HC57 220 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF124Q15973 351 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.28□□□□□ -0.6
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C17orf77Q96MU5 243 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RCHY1Q96PM5 261 aa11.28□□□□□ -0.6
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.28□□□□□ -0.6
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPP1P10451 314 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM78BQ5VT40 261 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MORN5Q5VZ52 161 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00052Q96N35 136 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa11.26□□□□□ -0.61
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DRB4P13762 266 aa11.26□□□□□ -0.61
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