RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390399.3

TRBV27-201, Transcript of T cell receptor beta variable 27, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV27, Length 387 nt, Biotype TR V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV27-201ENST00000390399 AGPAT2O15120 278 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 DEFB4AO15263 64 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 CST7O76096 145 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 IGKV3-20P01619 116 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 SULT1A1P50225 295 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 IL15RAQ13261 267 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 STX12Q86Y82 276 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 Q8NAQ8 132 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 MGST2Q99735 147 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RPRMQ9NS64 109 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 F6UB75 175 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 SIX6O95475 246 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 MIFP14174 115 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 HBG1P69891 147 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 HBG2P69892 147 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 FGL1Q08830 312 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RAB31Q13636 194 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PATE2Q6UY27 113 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 C20orf173Q96LM9 149 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 C17orf77Q96MU5 243 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 MFFQ9GZY8 342 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 ARV1Q9H2C2 271 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 XCL2Q9UBD3 114 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RNF24Q9Y225 148 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 X6R8D5 127 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 AGRNO00468 2067 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 A0A087X0K7 114 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 A0A0J9YX75 114 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 COX7A2P2O60397 106 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 S100A11P31949 105 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 CAMLGP49069 296 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 FXYD7P58549 80 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 BAXQ07812 192 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 VWC2Q2TAL6 325 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 FAM78BQ5VT40 261 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 NMES1Q9C002 83 aa6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 SSNA1O43805 119 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RLN2P04090 185 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 FGF7P21781 194 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PSG9Q00887 426 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 Q6ZRG5 221 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 RNF182Q8N6D2 247 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 ZNF709Q8N972 641 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 ZNF738Q8NE65 137 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 LYSTQ99698 3801 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.48□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 A8MTW9 85 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 E5RGE8 158 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 CXCL2P19875 107 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 H2BFSP57053 126 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 B2MP61769 119 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PRR20EP86478 221 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PRR20CP86479 221 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PRR20DP86480 221 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PRR20BP86481 221 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 PRR20AP86496 221 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 ATP6V1FQ16864 119 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 MIC13Q5XKP0 118 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.47□□□□□ -1.37
TRBV27-201ENST00000390399 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms