RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381565.2

APOBEC3F-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-202ENST00000381565 BCAP31P51572 246 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 SELENOTP62341 195 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 VWC2Q2TAL6 325 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 PATE2Q6UY27 113 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 STHQ8IWL8 128 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 UHRF2Q96PU4 802 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 NMES1Q9C002 83 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 SLC25A22Q9H936 323 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 A0A0J9YWU9 116 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 H0YIZ8 118 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 PSMB3P49720 205 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF546Q86UE3 836 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 HLA-DRB4P13762 266 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 C20orf173Q96LM9 149 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 ARL6Q9H0F7 186 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 H3BMM0 161 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 ISLRO14498 428 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 SSNA1O43805 119 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 HYPMO75409 117 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 PTTG1O95997 202 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 OR5G3P0C626 314 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 SPP1P10451 314 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 GALR1P47211 349 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 MORN5Q5VZ52 161 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 STX12Q86Y82 276 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 IL17DQ8TAD2 202 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 GPR82Q96P67 336 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 RSG1Q9BU20 258 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 ARV1Q9H2C2 271 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 ALG5Q9Y673 324 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3F-202ENST00000381565 F6UB75 175 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 CAMLGP49069 296 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 MEOX2P50222 304 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 RAP2BP61225 183 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 NHLH2Q02577 135 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 OPCMLQ14982 345 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 MIC13Q5XKP0 118 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 OR11H2Q8NH07 326 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00052Q96N35 136 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 RARRES2Q99969 163 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 KMT2AQ03164 3969 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 A0A087X0K7 114 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 E5RGE8 158 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 MPC2O95563 127 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 CXCL3P19876 107 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 S100A11P31949 105 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 ID1P41134 155 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 HBG1P69891 147 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 HBG2P69892 147 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 BAXQ07812 192 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 RNF182Q8N6D2 247 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF709Q8N972 641 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 Q8NAQ8 132 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 C16orf92Q96LL3 132 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 RNF126Q9BV68 326 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 X6R8D5 127 aa8.38□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 A0A0J9YX75 114 aa8.37□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 A8MTW9 85 aa8.37□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 COX7A2P2O60397 106 aa8.37□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
APOBEC3F-202ENST00000381565 FGF7P21781 194 aa8.37□□□□□ -1.07
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