RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 ORM2P19652 201 aa7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 ALDH3B2P48448 385 aa7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 RNF212Q495C1 297 aa7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF575Q86XF7 245 aa7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.32□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.32□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.3□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 BAP18Q8IXM2 172 aa7.3□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 RNF182Q8N6D2 247 aa7.3□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.3□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.3□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.3□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 C17orf77Q96MU5 243 aa7.3□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 PRSS46E5RG02 174 aa7.29□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.29□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 F5H768 121 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 H3BRN7 92 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 SFT2D2O95562 160 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 NUDT3O95989 172 aa7.28□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 TMBIM6P55061 237 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 RHOBP62745 196 aa7.28□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 PYDC2Q56P42 97 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 LRTM2Q8N967 370 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 MCFD2Q8NI22 146 aa7.28□□□□□ -1.24
CLRN3-201ENST00000368671 SOSTQ9BQB4 213 aa7.28□□□□□ -1.24
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CLRN3-201ENST00000368671 OR5G3P0C626 314 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 AP3S2P59780 193 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 RAP2BP61225 183 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 B2MP61769 119 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 KIR3DS1Q14943 382 aa7.27□□□□□ -1.25
CLRN3-201ENST00000368671 TRIM63Q969Q1 353 aa7.27□□□□□ -1.25
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