RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PSMG4Q5JS54 123 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 THAP6Q8TBB0 222 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 RSG1Q9BU20 258 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 DNAH7Q8WXX0 4024 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 KNCNA6PVL3 124 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 LINC00305Q7Z4B0 112 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 OVOL2Q9BRP0 275 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 NPCDR1Q9BY65 106 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 GIPP09681 153 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 GALR1P47211 349 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 GPR82Q96P67 336 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 WFDC1Q9HC57 220 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A9Q9NUM3 307 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 MPDU1O75352 247 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 S100A7P31151 101 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 APOC4P55056 127 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 DEFB1P60022 68 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 B2MP61769 119 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 CSTL1Q9H114 145 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 PXMP4Q9Y6I8 212 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 UBE2CO00762 179 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 COX7A2P2O60397 106 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZRG5 221 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZWC4 215 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 C20orf173Q96LM9 149 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 ATP5SQ99766 215 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 EDA2RQ9HAV5 297 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 G3V3Q6 166 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 ISLRO14498 428 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 RPL7P18124 248 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 PSMB3P49720 205 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 ACTL10Q5JWF8 245 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 C10orf113Q5VZT2 155 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 ASB13Q8WXK3 278 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 MEOX2P50222 304 aa16.33■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 GCSAMLQ5JQS6 135 aa16.33■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 GDF5OSQ5U4N7 250 aa16.33■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 STHQ8IWL8 128 aa16.33■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 A0A087X0K7 114 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 TRAV5A0A0B4J249 113 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 H3BMM0 161 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 ID1P41134 155 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 DEFB135Q30KP9 77 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 S100A7AQ86SG5 101 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 OR1L4Q8NGR5 311 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 RNF183Q96D59 192 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 LINC00052Q96N35 136 aa16.32■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 IGFL4Q6B9Z1 124 aa16.31■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 C16orf92Q96LL3 132 aa16.31■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa16.31■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 SPRY2O43597 315 aa16.3■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 FGL1Q08830 312 aa16.3■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 GATAD1Q8WUU5 269 aa16.3■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 AQP10Q96PS8 301 aa16.3■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 RFNGQ9Y644 331 aa16.3■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DRB4P13762 266 aa16.29■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 SAMD13Q5VXD3 122 aa16.29■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 PFDN5Q99471 154 aa16.29■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa16.29■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 F6UB75 175 aa16.28■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 IGLC2P0DOY2 106 aa16.28■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 C4BPBP20851 252 aa16.28■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa16.28■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 OR2T35Q8NGX2 323 aa16.28■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 RNF24Q9Y225 148 aa16.28■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 H3BQ15 152 aa16.27■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 CA1P00915 261 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DMBP28068 263 aa16.27■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa16.27■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 FOXI2Q6ZQN5 318 aa16.27■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 RNF182Q8N6D2 247 aa16.27■□□□□ 0.2
SYF2-201ENST00000236273 RNF222A6NCQ9 220 aa16.26■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 SPP1P10451 314 aa16.26■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 A0A0J9YX75 114 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 IFNA5P01569 189 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 ZNF709Q8N972 641 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 HRH4Q9H3N8 390 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.25■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 A8MTW9 85 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 C17orf112F2Z3M2 114 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms